El marco interinstitucional en el cual se desarrolla el programa está integrado por el Consejo de Administración, el Comité Consultivo y la Entidad Ejecutora.
El Consejo de Administración se integrará de la siguiente manera:
El Comité Consultivo es nombrado por el Consejo de Administración para cada área del fondo FANTEL, dicho Comité Consultivo está integrado por un mínimo de 5 personas procedentes del sector oficial correspondiente y de la sociedad civil relacionada al tema.
La Entidad Ejecutora es FEDISAL
FEDISAL es una institución privada sin fines de lucro, fundada en 1992 por empresarios y miembros de la Institución Salesiana de El Salvador, con el fin de fomentar el desarrollo de la población salvadoreña, con una prioridad de trabajar por medio de la educación.
FEDISAL se especializa en la formulación y administración de proyectos sociales tanto de las instituciones salesianas como de otras instituciones nacionales e internacionales. Desde 1992 ha ejecutado muchos proyectos a escala nacional, coordinando a múltiples instituciones educativas, en el marco de procesos transparentes y caracterizándonos por una excelente calidad de los servicios.